Риск от инфекция с BA.5 сред хора, изложени на предишни варианти на SARS-CoV-2

До редактора:

През последните месеци омикрон (B.1.1.529) се превърна в доминиращ вариант на тежък остър респираторен синдром коронавирус 2 (SARS-CoV-2), показващ известна степен на имунно избягване.¹ Първичните подварианти на омикрон, BA.1 и BA.2, постепенно се изместват от BA.5 в много страни, вероятно поради повишена трансмисивност и частично избягване на имунитета, причинени от BA.1 и BA.2.^2,3 Защитата, осигурена от BA.1 срещу инфекция от подпроменливата BA.5, е критична, тъй като адаптираните ваксини в клиничните изпитвания се основават на BA.1.

Португалия беше една от първите страни, засегнати от господството на BA.5. Използвахме Националния регистър за коронавирусна болест 2019 (Covid-19) (SINAVE), за да изчислим риска от инфекция с BA.5 сред субекти с документирана инфекция с предишни варианти, включително BA.1 и BA.2. Регистърът включва всички регистрирани случаи в страната, независимо от клиничната изява.

Фигура 1. Фигура 1. Защитен ефект от предишна инфекция със SARS-CoV-2 върху инфекция с варианта Omicron BA.5.

Както е показано в панел (а), идентифицирахме периодите (в различни цветове), в които единичен вариант е представен в повече от 90% от пробните изолати (данни от националния тежък остър респираторен синдром коронавирус 2). [SARS-CoV-2] контрол на генетичното разнообразие⁴). Периодите в сиво представляват моментите, когато повече от една променлива е била в обращение. Предвид сравнително бавния преход между доминирането на варианта omicron BA.1 и доминирането на варианта omicron BA.2, ние обединихме BA.1 и BA.2 в анализа. Не включихме никакви субекти, заразени в рамките на 90 дни преди доминирането на субфактора omicron BA.5. Панел Б показва ефикасността на защитата срещу инфекция по време на контролния период на BA.5 (от 1 юни 2022 г.) сред субекти с единична инфекция в периодите на доминиране на различните варианти, както е показано в панел А, в сравнение с субекти без документиран инфекция от 1 юни. Хората с инфекция преди 1 юни не са включени в проучването. 𝙸 Лентите представляват 95% доверителни интервали.

Националното генетично наблюдение за SARS-CoV-2 идентифицира периоди, в които различни варианти представляват повече от 90% от изолатите.⁴ Идентифицирахме всички субекти, които са имали първата си инфекция в контролните периоди за всяка променлива, за да изчислим техния риск от инфекция по време на контролния период BA.5 (Фигура 1а). Обединихме BA.1 и BA.2 поради бавния преход между двете подпроменливи в популацията. И накрая, изчислихме риска от BA.5 за население, което не е имало документирана инфекция преди доминирането на BA.5 (1 юни 2022 г.).

Установихме, че предишна инфекция със SARS-CoV-2 е имала защитен ефект срещу инфекция с BA.5 (Фигура 1b и Таблица S1 в Допълнителното приложение, достъпно с пълния текст на това писмо на NEJM.org), и тази защита е била максимална за предишна инфекция с BA.1 или BA.2. Тези данни трябва да се разглеждат в контекста на проникващата инфекция при високо ваксинирана популация, като се има предвид, че повече от 98% от изследваната популация в Португалия е завършила първичната ваксинационна серия преди 2022 г.

Дизайнът на изследването не може да елиминира всички объркващи фактори (вижте дискусионния раздел в Допълнителното приложение). В допълнение, едно ограничение е предполагаемият ефект от намален имунитет в популация с хетерозиготен имунитет (предишна инфекция и ваксинация). Установихме, че инфекцията с BA.1 или BA.2 при ваксинирани субекти осигурява по-висока защита срещу BA.5, отколкото инфекцията с варианти преди омикрон, в съответствие с скорошен доклад за отрицателен дизайн на теста.⁵ Инфекциите с BA.1 или BA.2 обаче са настъпили по-близо до периода на доминиране на BA.5, отколкото инфекциите с по-ранни варианти. Има схващане, че защитата, предлагана от предишна инфекция с BA.1 или BA.2, е много ниска, предвид големия брой инфекции с BA.5 сред лица, заразени преди това с вируса BA.1 или BA.2. Нашите данни предполагат, че това възприятие вероятно е резултат от по-голяма група субекти с BA.1 или BA.2 инфекция в сравнение с инфекция от други подпроменливи и не се подкрепя от данните.

Като цяло открихме, че проникващите инфекции с варианта BA.5 са по-малко вероятни сред хора с предишна анамнеза за SARS-CoV-2 в силно ваксинирана популация, особено за предишни инфекции BA.1 или BA.2, отколкото сред неинфектирани лица .. .

Жоао Малато, MA.
Molecular Instituto de Medicina João Lobo Antunes, Лисабон, Португалия

Рой М. Рибейро, Фил Д.
Национална лаборатория в Лос Аламос, Лос Аламос, Ню Мексико

Педро П. Лейте, д-р
Педро Касака, д-р
Евгения Фернандес, д-р.
Direção Geral da Saúde, Лисабон, Португалия

Карлос Антунес, Ph.D.
Университет на Лисабон, Лисабон, Португалия

Валтер Р. Фонсека, MD, Ph.D.
Direção Geral da Saúde, Лисабон, Португалия

Мануел С. Гомес, д-р.
Университет на Лисабон, Лисабон, Португалия

Луис Грака, доктор по медицина, Фил Д.
Molecular Instituto de Medicina João Lobo Antunes, Лисабон, Португалия
[email protected]

Това съобщение беше публикувано на 31 август 2022 г. в NEJM.org.