Скенерите на метрото откриват микробна гора и хиляди нови видове

Екипи от изследователи и доброволци се разпространяват в системите за масови транзити в 60 града, като събират хиляди проби от 2015 до 2017 г. Те изследваха различни повърхности, включително турникети, парапети, кабинки за билети и седалки в транзитните станции и вагоните на метрото. (В малкото градове без системи на метро екипите се фокусираха върху автобусната или влаковата система.)

Мисиите на учените да вземат основни проби често привличат вниманието. Някои пътници станаха толкова любопитни, че се присъединиха към доброволческите анкети, докато други настояваха, че никога не искаха да разберат какво живее на стълбовете на метрото. Понякога пътниците не разбират какво правят изследователите с техните малки петна. „Един от мъжете ни благодари прекалено, че почистихме метрото“, каза д-р Мейсън.

Изследователите също така събраха проби от въздух от транспортни системи в шест града – Ню Йорк, Денвър, Лондон, Осло, Стокхолм и Хонг Конг – за да получат придружаващ документ за „атмосферния микробиом“, който беше Публикувано е в сряда в Microbiome.

„Това е огромно“, казва Ерика Хартман, микробиолог от Северозападния университет, който не е участвал в изследването. „Броят на пробите и географското разнообразие на пробите – това е безпрецедентно.“

След това екипът извлече и секвенира ДНК от всяка проба, за да определи кой вид съдържа. Общо във всички повърхностни проби те откриха 4246 известни вида микроорганизми. Две трети от тези бактерии са бактерии, а останалите са смес от гъби, вируси и други видове микроби.

Но това беше само началото: Те също така откриха 10 928 вируса и 748 вида бактерии, които никога не са били документирани. „Можем да видим, че това са били истински – те са микроорганизми – но те не са никъде в никоя база данни,“ Даниела Бездан, бивш главен изпълнителен директор на MetaSUB, която сега е асистент изследовател в университетската болница Тюбинген, Германия, каза.

Експертите твърдят, че по-голямата част от тези организми би представлявала малък риск за хората. Почти всички открити нови вируси, каза д-р Данко, вероятно са фаги или вируси, които заразяват бактериите. Освен това генетичната последователност не може да прави разлика между мъртви и живи организми и няма стерилна среда. Всъщност телата ни зависят от богата и динамична общност от микроби, за да функционират правилно.