CDC се обръща към наблюдение на изпражненията за бъдещо наблюдение на COVID

Центровете за контрол и превенция на заболяванията обявиха в петък, че сега регистрират нивата на SARS-CoV-2, открити в отпадъчните води от цялата страна. Рекламата повдига а Нарастваща система за мониторинг на отпадъчните води Което според CDC в крайна сметка ще бъде насочено към други инфекциозни заболявания.

Системата започна като масово изследователско усилие през 2020 г., но се разрасна в мрежа от повече от 400 места за вземане на проби от канализацията в цялата страна, представляващи изпражненията на близо 53 милиона американци. CDC сега работи с 37 щата, четири града и две територии, за да добави още места за вземане на проби от отпадъчни води. Здравната агенция очаква да има още 250 уебсайта онлайн през следващите седмици и повече след това през следващите месеци.

На брифинг за пресата в петък д-р Ейми Кърби, ръководител на програмата на CDC за Националната система за наблюдение на отпадъчните води (NWSS), описа вземането на проби като критична система за ранно предупреждение за мутации и варианти на COVID-19, както и „нова граница на инфекцията и наблюдение на болести в Съединените щати.“

„Смята се, че между 40 и 80 процента от хората, заразени с COVID-19, отделят своята вирусна РНК. [from SARS-CoV-2] в техните изпражнения, което прави канализацията и отпадните води важна възможност за наблюдение на разпространението на инфекцията“, каза Кирби. Това отделяне започва почти веднага по време на инфекцията, преди човек да започне да показва симптоми и понякога няколко дни преди човек да получи положителен резултат от теста Освен това тези сигнали в калта не се влияят от наличието на тестове или достъпа до здравни грижи.

Досега в сянката на пандемията проследяването на отпадъчните води на различни места елиминира ранните признаци на колебания и внезапни увеличения, понякога предвещаващи скок в случаите дни преди да се случат. Като цяло тенденциите в нивата на РНК в отпадъчните води са тясно свързани с честотата на случаите, процента на хоспитализация и положителния тест, отбеляза Кирби. Наличието на това разширено предупреждение може да помогне на здравните служители да се подготвят и предотвратят скок. Например, служителите може да са в състояние да насочат мобилните тестове към общности, които виждат ранно повишаване на нивата на РНК или увеличават болничните ресурси в райони, в които се очаква увеличение на случаите.

„Тези допълнителни дни могат да променят крайния път на това увеличение във вашата общност“, каза Кърби.

Насоки и планове

На новия CDC Уебсайт за проследяване на данни на NWSS, хората могат да видят цветни промени в нивата на РНК на различни места за наблюдение на отпадъчните води. Сайтове, оцветени в синьо, например, са наблюдавали 100% спад в нивата през последните 15 дни, докато сайтовете, оцветени в червено, са отбелязали увеличение от 1000%.

Мониторингът на отпадъчните води често е полезен за разглеждане на тенденции като тези – независимо дали случаите се движат нагоре или надолу. Това не показва ясно колко SARS-CoV-2 е присъствал в популацията в даден момент и изследователите не са установили прага на откриване. Тоест, не е ясно колко хора в дадена канализационна зона трябва да бъдат заразени, за да се появи положителна проба от отпадни води.

Но е ясно, че мониторингът се оказа ефективен при откриване на внезапни увеличения и предстоящи променливи. Например в а Проучването на CDC, публикувано в края на миналия месецKirby и колеги съобщават, че няколко обекта за мониторинг на канализацията са открили вариант на вируса на омикрон, преди да бъдат открити случаи на омикрон в отделни държави.

Тъй като SARS-CoV-2 преминава от фаза на остра пандемия към по-тиха ендемична фаза, Кърби и нейните колеги очакват, че отпадъчните води ще помогнат за откриване на местни — вероятно сезонни — увеличения, както и пристигането на нови променливи. Но вземането на проби има своите граници. Първо, голяма част от Съединените щати ще пропуснат да използват канализационни системи – около 20 процента от домовете в САЩ – вместо общински канали. В допълнение, дешифрирането на мутации може да бъде по-трудно в райони с преходни популации, като горещи точки за туризъм.

Въпреки това, вземането на проби се оказа достатъчно полезно, за да убеди Центровете за контрол и превенция на заболяванията да инвестират в повече мониторинг на отпадъчните води. В допълнение към повече места за вземане на проби, Кърби каза, че агенцията планира да разшири наблюдението тази година, за да включи и други патогени, включително грип, устойчивите на лекарства гъбички. Candida aurisи хранителни заплахи като напр коли бактерии Норовирусът.